Partionen entfernen

Ich habe Anfang letzten Jahres mein Betriebssystem von ME auf XP umgestellt, vorsichtshalber aber ME auf einer extra eingerichteten Partion 2 zunächst abgespeichert und dort ca. 6 Monate auch noch zwischendurch benutzt für Donwloads der dort noch bestehenden Sicherheitsprogramme (andere wie auf der XP Partion 1),usw.aber sonst nicht mehr mit gearbeitet.
Da ich mir einen neuen Computer zulegen will,dachte ich, ich könnte mit einem Löschprogramm (welchem??) einfach die 2.Par.ME löschen, vorher die 1.Part. XP auf eine vorhandene ext. Festplatte überspielen,zB. mit HDClone3.6, oder?? das mit dem Ghost-Backup Programm erstellte Backup der kompl. Part.1 (nachdem das Ghost- Progamm auf dem neuen Comp. inst. ist).
Jetzt stelle ich aber fest,das ein Teil(wieso nur ein Teil?)der Dateien die ich eindeutig nur in Part.1,also mit XP erstellt habe, auch in der Part.2 auftauchen und wenn ich dies hier in den Papierkorb verschiebe, diese Dateien dann auch in der Part.1 verschwunden sind.
Das bedeutet doch, wenn ich die Part.2 komplett lösche ( womit und wie wäre hier auch die Frage?)auch die dort evtl. vorhandenen,eigentlich nur zu Part.1 gehörigen Dateien hier auch "entfleuchen".
Wer hat hier gute Tips, bzw. ähnliche Probleme gehabt und kann mir helfen,wenn zu umfangreich dann am besten mi einer Mail:
"zagel13@feierabend.de"
Im voraus herzlichen Dank und allen Lesern ein nicht zu stürmisches, dafür schönes Winterwochenende
Gruß Wolfgang.